中央部門屬社會公益類科研機構(gòu)是實施科教興國戰(zhàn)略，支撐科學(xué)發(fā)展，建設(shè)創(chuàng)新型國家的主力軍。自1996年中央部門屬公益類科研機構(gòu)改革試點至今，在加大科技投入和創(chuàng)新能力建設(shè)方面取得明顯成效。經(jīng)過多年的實踐，有必要繼續(xù)深化改革，切實解決體制機制、配套政策等深層次矛盾以及改革遺留問題。目前，公益類科研機構(gòu)改革還有待在如下幾個方面進一步深化：
　　
    1、非營利機構(gòu)編制總量與結(jié)構(gòu)亟待調(diào)整。自2001年至今，科技部、財政部、中編辦先后對中央26個部門所屬265所社會公益類科研機構(gòu)作出改革方案批復(fù)：核定非營利性機構(gòu)101個，占機構(gòu)總數(shù)的36%；非營利性編制近1.5萬人，占原有編制總數(shù)的20％，擬轉(zhuǎn)為企業(yè)61個，占機構(gòu)總數(shù)的25%。其余機構(gòu)分別并入大學(xué)，屬地化管理、轉(zhuǎn)為部門事業(yè)單位或中介機構(gòu)�；�本實現(xiàn)了當初頂層設(shè)計的目標——重點支持100個機構(gòu)、1.5萬人。隨著世界科技發(fā)展突飛猛進，普遍反映非營利性機構(gòu)與編制總量嚴重不足，難以滿足支撐發(fā)展的需求。
　　
    2、擬轉(zhuǎn)制為企業(yè)的公益類科研機構(gòu)創(chuàng)新能力嚴重削弱。被核定為擬轉(zhuǎn)制的機構(gòu)長期從事公益性研發(fā)任務(wù)和基礎(chǔ)性服務(wù)工作，承擔帶動本行業(yè)科技進步的重任，其中不乏基礎(chǔ)性研究領(lǐng)域。以農(nóng)林水三部門為例，被核定轉(zhuǎn)制的31個機構(gòu)，不僅在本行業(yè)科技創(chuàng)新中居于龍頭地位，而且承擔大量應(yīng)用基礎(chǔ)研究和公益型研發(fā)任務(wù)。特別是在生物質(zhì)新能源、新材料等前沿領(lǐng)域具有雄厚的科學(xué)積累和服務(wù)實力。這些科研機構(gòu)的發(fā)展狀況事關(guān)國計民生，既不可或缺，也不具備面向市場的能力。
　　
    3、部分科研機構(gòu)劃為部門事業(yè)單位發(fā)展受到嚴重制約。公益類科研機構(gòu)改革將部分科學(xué)事業(yè)單位轉(zhuǎn)為部門事業(yè)單位，出現(xiàn)了“一院三制”的局面，即在同一科學(xué)（研究）院內(nèi)出現(xiàn)科學(xué)事業(yè)單位、部門事業(yè)單位、科技型企業(yè)三種管理體制。這些機構(gòu)既無加大支持的增量經(jīng)費，也無相應(yīng)的政策扶持，陷入進退維谷的被動局面。
　　
    4、各項配套政策支持嚴重滯后。突出表現(xiàn)在分配制度不合理、地方補貼不到位、社會保障不配套。改革中形成的基礎(chǔ)工資、崗位津貼和績效工資“三元結(jié)構(gòu)”分配制度，因有關(guān)部委“八不準”規(guī)定和調(diào)整科技專項計劃相關(guān)規(guī)定，造成“績效工資”無法兌現(xiàn)，科研人員工資收入與公務(wù)員、高校等差距進一步拉大。
　　
    此外，近年來各地出臺的各項提高在職人員及離退人員的地方性補貼，中央直屬事業(yè)單位人員均無法享受�？蒲袉挝火B(yǎng)老、醫(yī)療等“五險一金”的社會保障體系尚不完善，大大加重了科研單位的負擔。
　　
    為此，我們建議，盡快從人員、編制、保障、立法等多個層次深化中央公益類科研機構(gòu)改革，探索建立現(xiàn)代科研院所制度：
　　
    1、適當調(diào)整和增加非營利科研機構(gòu)和人員編制。根據(jù)“整合資源、調(diào)整總量、科學(xué)布局、適當重組”的原則，經(jīng)論證評估，重組和建立一批非營利科研機構(gòu)，適當增加非營利編制和科研輔助崗位；同時，允許科研院所在不增加現(xiàn)有法人數(shù)量和編制的前提下，自行調(diào)整或設(shè)置內(nèi)部研究機構(gòu)。
　　
    2、繼續(xù)加大科學(xué)事業(yè)費投入。一是將事業(yè)費從目前每年人均5萬元逐步提高到人均8-10萬元的水平。二是結(jié)合國家引進海外高層次人才的“千人計劃”，為涉農(nóng)類公益研究院所專門設(shè)立人才引進專項經(jīng)費，培養(yǎng)和造就一批具有國際水平的科技帥才和領(lǐng)軍人物。三是加大科研基礎(chǔ)設(shè)施與條件建設(shè)的投入，重點支持國家實驗室、國家重點實驗室、野外觀測臺站等基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)。四是按人員編制足額拔付經(jīng)費，在此前提下實現(xiàn)固定人員+流動人員的人事制度，允許科研院所利用缺編人員經(jīng)費自主聘用科研人員和科研輔助人員。
　　   
    3、加快建立公益類科研機構(gòu)社會保障體系。盡快建立公益類科研機構(gòu)社會保障體系，完善相應(yīng)的配套政策（包括失業(yè)、養(yǎng)老、工傷、生育、醫(yī)療保險以及住房公積金等），從源頭上解除科研機構(gòu)和科研人員的后顧之憂，使學(xué)術(shù)帶頭人和將帥之才“出得來，留得住，引得進，流得動”。
　　
    4、積極推進科學(xué)事業(yè)單位規(guī)范管理的立法進程。要解決阻礙科技創(chuàng)新步伐、制約科技創(chuàng)新活力的瓶頸，單純依靠行政手段已難以奏效，有必要通過立法程序，將科學(xué)事業(yè)單位管理納入規(guī)范化、法制化管理的軌道，從根本上理順體制，創(chuàng)新機制，有效調(diào)動公益類科研機構(gòu)和廣大科研人員的創(chuàng)造力，加快建設(shè)創(chuàng)新型國家的進程。建議將“科學(xué)事業(yè)單位管理條例”納入國務(wù)院立法計劃。