長三角地區(qū)是我國重要的經(jīng)濟增長極，其經(jīng)濟總量占全國的20％以上。目前，長三角地區(qū)已進入由投資驅動向創(chuàng)新驅動轉型的發(fā)展階段，加快地區(qū)間的科技創(chuàng)新合作既有條件又有必要。2003年，三地簽訂了《滬蘇浙共同推進長三角創(chuàng)新體系建設協(xié)議書》，并建立了“長三角創(chuàng)新體系建設的聯(lián)席會議”制度。這種通過建立工作機制推動三地的科技創(chuàng)新合作，取得了很好的成效。

目前三地科技創(chuàng)新合作主要存在以下三個問題：

1.在行政設置分割情況下，三地產(chǎn)業(yè)不互補，市場不統(tǒng)一，資源配置效率低，資源短缺與浪費并存，使得三地科技合作的進一步發(fā)展受到限制。

2.三地相關部門間合作機制欠缺，政府層面在科技合作方面的制度性安排不多，合作政策缺乏銜接，區(qū)域內技術轉移和科技資源共享的長效機制薄弱。

3.區(qū)域內要素流動的市場環(huán)境和市場體系不完善，科技協(xié)調發(fā)展機制軟弱。

建議從以下六個方面，推動當前和今后三地科技創(chuàng)新合作向一體化轉變：

1.建立省部級長三角科技創(chuàng)新協(xié)調機制

長三角地區(qū)初步建立了科技合作機制，也取得了一定成效。在新時期建設創(chuàng)新型區(qū)域的要求下，區(qū)域合作需要從國家更高層面來協(xié)調推動。

2.推動建立“國家科技創(chuàng)新綜合試驗示范區(qū)”

這是關系到長三角能否依靠創(chuàng)新率先發(fā)展的一個戰(zhàn)略性措施。要結合長三角直面國際競爭的特點，以提高產(chǎn)業(yè)國際競爭力為主要目標，開展自主創(chuàng)新試點示范。